江門邊防檢查站前身為“拱北邊防檢查站江門分站”；1984年11月，江門邊防檢查站正式宣布成立，正團編制，內設辦、政、后三大機關；下轄三埠分站(副團級，現(xiàn)開平邊檢站)，隸屬武警廣東總隊領導。1986年6月，經(jīng)上級批準，在陽江、恩平等6個貨運口岸設立邊防檢查工作組；1988年10月，鶴山至香港通航，江門邊防檢查站鶴山分站成立；1993年9月，新會至香港通航，江門邊防檢查站負責籌建新會邊防檢查站，并代管新會邊防檢查站；1994年12月、1995年6月，三埠、新會邊防檢查站先后升格為正團級檢查站，從江門邊檢站分離。

江門邊防檢查站現(xiàn)屬正團職、二類邊防檢查站，隸屬于廣東省公安邊防總隊，內設司令部、政治處、后勤處三部門，下轄鶴山分站（副團級）；現(xiàn)擔負江門港、鶴山港兩個一類口岸及外海、高沙、荷塘、鶴山、恩平五個二類口岸的出入境邊防檢查任務。年均驗放出入境人員達30萬人次，往來港澳小型船舶約1萬艘次。

一直以來，江門邊防檢查站始終堅持以服務為中心，不斷深化勤務改革，改善通關環(huán)境，全心助力江門成為廣東改革發(fā)展的“開放之門”，全意服務廣大出入境對象安全順暢通關，全力構筑維護國家安全和社會穩(wěn)定的堅實屏障，樹立了“中國邊檢·陽光國門”形象，擦亮了“僑鄉(xiāng)邊檢·貼心服務”品牌，贏得了廣泛贊譽